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Si possono scrivere programmi di shell creando script contenenti alcuni comandi di shell. La prima linea dello script deve iniziare con #!, che indica al kernel che lo script è direttamente eseguibile. Si fa immediatamente seguire a quel simbolo il nome della shell o del programma da eseguire (gli spazi sono permessi), usando un path name assoluto. Generalmente si possono avere fino a 32 caratteri, forse di più su alcuni sistemi e si può includere qualche opzione. Quindi per inizializzare uno script per la shell Bourne la prima linea dovrà essere:
#! /bin/sh
e per la shell C:
#! /bin/csh -f
dove l'opzione -f indica che la shell non deve leggere il file .cshrc. Alcuni spazi bianchi seguenti il magico simbolo, #!, sono opzionali.
Inoltre si deve specificare che lo script è eseguibile, settando gli opportuni bit sul file con il comando chmod(1), esempio:
% chmod +x shell_script
All'interno degli script il simbolo # indica un commento da quel punto fino alle fine della linea; #! è un caso speciale se trovato come primo carattere del file.
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